Boostをビルドするためのツールであるbjam*1はBoostにソースだけ同梱されています。Boostをダウンロードして展開するとルートディレクトリにbootstrap.bat(bootstrap.sh)がありますので、これを実行するとビルドが実行され、ルートディレクトリの下にbjam.exeが生成されます。
実際のビルド処理は(Windowsの場合)tools/build/v2/engine/src/build.batにあり、VCなどがインストールされているとそれらを勝手に使ってくれるようです。便利ですね。
*1:他にも使ってるプロジェクトとかあるのかな
